Sekolah Menengah Kejuruan (SMK) Negeri 3 Manokwari atau yang lebih di kenal dengan Sekolah Pariwisata didirikan pada tahun 2007 berdasarkan kesepakatan bersama antara Direktur Pembinaan SMK dan Bupati Manokwari No. 0571L/C5.4/KEP/KU/2007 Tentang Pendiriian USB-SMK Daerah Perbatasan/ Tertinggal SMK N 3 Manokwari. SMK Negeri 3 Manokwari terletak di Jl. Ekonomi Reremi, di atas tanah seluas 15.645 m2. Memiliki total 11 ruang kelas dan 1 ruang administrasi saat ini dipimpin oleh Bapak George T.G. Gaspers, S.Pd sebagai kepala sekolah. SMK Negeri 3 Manokwari memiliki lima jurusan pendidikan yaitu perhotelan, tata boga, tata busana, jurusan perjalanan wisata dan konservasi sumberdaya alam.
Pada tahun ajaran 2017/2018, tercatat bahwa SMK Negeri 3 Manokwari memiliki total anak didik sebanyak 120 siswa/i dari berbagai lulusan Sekolah Menengah Pertama (SMP) baik dari Papua Barat maupun dari luar Papua Barat. Sekolah ini total memiliki 29 guru yang terbagi dalam dua kategori yaitu 23 guru tetap dan 6 guru tidak tetap, serta 3 tenaga tata usaha.